Высшим руководящим органов ВООП является Съезд, который созывается не реже одного раза в 5(пять) лет.

К компетенции Съезда относится:

1. Утверждение Устава ВООП, внесение в него изменений и дополнений.
2. Определение приоритетных направлений и программ деятельности ВООП на предстоящий период, путей и методов их реализации.
3. Рассмотрение и утверждение отчета Центрального совета и Центральной контрольной комиссии ВООП.
4. Определение принципов финансовой деятельности, формирования и использования имущества ВООП.
5. Принятие решений, резолюций, заявлений, обращений по важнейшим экологическим проблемам страны, деятельности органов государственной власти в области экологии, по вопросам жизни ВООП.
6. Избрание Центрального совета ВООП, Председателя Центрального совета ВООП и Центральной контрольной комиссии ВООП, а также досрочное прекращение их полномочий.
7. Принятие решений о создании филиалов и открытии представительств ВООП.
8. Избрание Председателя Попечительского совета ВООП.
9. Принятие решений о реорганизации ВООП или его ликвидации.